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python:anaconda

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python:anaconda [2020/05/13 20:45]
Francesco Beretta [Anaconda/Miniconda]
python:anaconda [2020/09/29 10:03]
Francesco Beretta
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 Retour à l'​accueil [[python:​accueil|Python pour les historiens]] Retour à l'​accueil [[python:​accueil|Python pour les historiens]]
  
-======= Installer et configurer son environnement Python =======+======= Installer et configurer son environnement ​virtuel ​Python ======= 
 + 
 +Les environnements virtuels fournissent un moyen puissant pour isoler les dépendances de paquets d’un projet. Cela signifie que vous pouvez utiliser des paquets particuliers à un projet Python sans les installer sur l’ensemble du système et ainsi en évitant ainsi la les conflits de version potentiels. 
 +Cf. [[https://​docs.python.org/​fr/​3/​tutorial/​venv.html|Environnements virtuels et paquets]]
  
  
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   * [[https://​www.anaconda.com/​what-is-anaconda/​|Ce qu'est Anaconda]] – [[https://​docs.conda.io/​projects/​conda/​en/​latest/​index.html|ce qu'est **Conda**]]   * [[https://​www.anaconda.com/​what-is-anaconda/​|Ce qu'est Anaconda]] – [[https://​docs.conda.io/​projects/​conda/​en/​latest/​index.html|ce qu'est **Conda**]]
-  * Installer ​[[https://​www.anaconda.com/​download/​|Anaconda]] ou [[https://​docs.conda.io/​en/​latest/​miniconda.html|Miniconda]]. Dans le cadre de ce tutoriel, la version de python pouvant être utilisée est la **3.7**. +  * Installer [[https://​docs.conda.io/​en/​latest/​miniconda.html|Miniconda]]. Dans le cadre de ce tutoriel, la version de python pouvant être utilisée est la **3.7**. 
-    * Quelle différence entre Anaconda et Miniconda ? Anaconda apporte, en plus du gestionnaire d'​environnements Python conda, une interface graphique complète et différents logiciels. L'​environnement risque d'​être un peu lourd – pour des petits projets **Miniconda** est préférable. Il n'est pas recommandé,​ dans le cadre de cet atelier, de créer un environnement avec le logiciel Anaconda, car cela pose problème par la suite.+    * Quelle différence entre Anaconda et Miniconda ? [[https://​www.anaconda.com/​download/​|Anaconda]] apporte, en plus du gestionnaire d'​environnements Python ​//conda//, une interface graphique complète et différents logiciels. L'​environnement risque d'​être un peu lourd – pour des petits projets **Miniconda** est préférable. Il n'est pas recommandé,​ dans le cadre de cet atelier, de créer un environnement avec le logiciel Anaconda, car cela pose problème par la suite.
   * [[https://​zestedesavoir.com/​tutoriels/​1448/​installer-un-environnement-de-developpement-python-avec-conda|Tutoriel en français]] concernant l'​utilisation de //conda//.   * [[https://​zestedesavoir.com/​tutoriels/​1448/​installer-un-environnement-de-developpement-python-avec-conda|Tutoriel en français]] concernant l'​utilisation de //conda//.
   * [[https://​docs.conda.io/​projects/​conda/​en/​latest/​user-guide/​getting-started.html|Tutoriel en anglais]] de conda   * [[https://​docs.conda.io/​projects/​conda/​en/​latest/​user-guide/​getting-started.html|Tutoriel en anglais]] de conda
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   * Exécuter tout d'​abord une mise à jour de Conda: ​ <​code>​conda update conda</​code>​   * Exécuter tout d'​abord une mise à jour de Conda: ​ <​code>​conda update conda</​code>​
     * Lorsque l'​exécutable imprime la liste des paquets à mettre à jour et  demande: installer y/n ? répondre y = yes     * Lorsque l'​exécutable imprime la liste des paquets à mettre à jour et  demande: installer y/n ? répondre y = yes
 +  * Lister les environnemnents disponibles <​code>​conda env list</​code>​
   * Créer ensuite un environnement contenant Jupyter Lab: conda create --name <​envname>​ python=<​version>​.   * Créer ensuite un environnement contenant Jupyter Lab: conda create --name <​envname>​ python=<​version>​.
   * <​code>​ [suggestion:​] conda create --name py37_gitlab python=3.7 jupyterlab=1.2.7 jupyterlab-git </​code>​   * <​code>​ [suggestion:​] conda create --name py37_gitlab python=3.7 jupyterlab=1.2.7 jupyterlab-git </​code>​
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   * Démarrer Juypter Lab : <​code>​jupyter lab</​code>​   * Démarrer Juypter Lab : <​code>​jupyter lab</​code>​
   * Si on veut ajouter des nouveau paquets à l'​environnement,​ arrêter Jupyter Lab (alt-C pour Windows ou ctrl-C pour Mac), puis ajouter les paquets à l'​environnement actif, dans ce cas //​py37_gitlab//​ puis relancer le Lab.   * Si on veut ajouter des nouveau paquets à l'​environnement,​ arrêter Jupyter Lab (alt-C pour Windows ou ctrl-C pour Mac), puis ajouter les paquets à l'​environnement actif, dans ce cas //​py37_gitlab//​ puis relancer le Lab.
 +  * Pour utiliser différents environnements,​ dédiés à différents projets ou technologies (NLP, etc.) voir les [[python:​environnement_conda&#​creer_un_nouvel_environnement_atelier_et_l_ajouter_aux_kernels_de_jupyter_lab|instructions sur cette page]]
  
 \\ \\
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 ==== Problèmes / Bugs ==== ==== Problèmes / Bugs ====
  
-=== Problème au lancement de Anaconda === +Voir les [[python:bugs_connus_conda|Problèmes ​Bugs]] connus concernant ​l'​installation de Miniconda ou de ses plugins
- +
-  * Sous Windows, si le kernel ne démarre pas, avec l'​erreur "​manque win32api",​ insaller: <​code>​conda install pywin32</​code>​ +
- +
-  * Sous Windows 7 problème au lancement de Anaconda. Solution qui marche ([[https://​github.com/​ContinuumIO/​anaconda-issues/​issues/​1467|Source]]) :​ +
- +
-PROBLEM: Anaconda Navigator won't start (nor will Spyder, IPython, ...). Error is reported: +
-This application failed to start because it could not find or load the Qt platform plugin "​windows"​ in ""​ +
- +
-SOLUTION: +
-Copier le dossier +
-Continuum\Anaconda3\Library\plugins\platforms +
-vers le dossier +
-Continuum\Anaconda3 +
- +
-   * Sous Windows 10 problème lorsque on teste <​code>​conda list</code> renvoit l'​erreur : <​code>​conda:​ command not found error</​code>​. +
-SOLUTION:  +
-     * voir cette documentation : [[https://​support.anaconda.com/​hc/​en-us/​articles/​360023863234-Conda-command-not-found-error|Conda:​ "​command not found" error]], complété par **[[https://​stackoverflow.com/​questions/​44597662/​conda-command-is-not-recognized-on-windows-10?​answertab=active#​tab-top|ces explications très utiles]]**. +
-     * voir éventuellement cette [[https://​stackoverflow.com/​questions/​18675907/​how-to-run-conda?​answertab=active#​tab-top|documentation supplémentaire]] +
- +
-===== Linux Ubuntu 18.04 - Mint 19 ===== +
- +
-[Étapes suivies dans Linux Mint 19.3 Tricia - Pierre 2020-04-02] +
- +
-Création de l'environnement en indiquant seulement la version python +
- +
-<​code>​conda create --name py37_gitlab python=3.7</​code>​ +
- +
-activation de l'​environnement +
- +
-<​code>​conda activate py37_gitlab</​code>​ +
- +
-installation de jupyterlab 1.2.7 +
- +
-<​code>​conda install jupyterlab=1.2.7</​code>​ +
- +
-installation ​de nodejs (qui n'est pas installé avec jupyterlab 1.2.7 d'où problème ensuite pour gérer les extensions) : +
- +
-<​code>​conda install -c conda-forge nodejs</​code>​ +
- +
-installation de jupyterlab-git : +
- +
-<​code>​conda install -c conda-forge jupyterlab-git</​code>​ +
- +
-lancer jupyterlab :  +
- +
-<​code>​jupyter lab</​code>​ +
- +
-  * Ensuite, suivre les indications qui suivent pour les extensions jupyterlab-git (accepter la proposition d'​installation du "​Server companion"​ jupyterlab_git (avec un underscore),​ puis jupyterlab-github. :!: Après avoir cliqué sur l'​icône "​puzzle"​ (pour les extensions),​ il faut attendre un peu avant que la liste des extensions s'​affiche. +
- +
-:!: Mais il reste un problème : <​code>​ "​nbdime-jupyterlab@2.0.0"​ is not compatible with the current JupyterLab </​code>​. +
- +
-J'ai donc essayé de remplacer la version de nbdime.2.0.0 par la nbdime.1.1.0. D'​abord on désactive nbdime : +
- +
-<​code>​ jupyter nbextension disable --py nbdime</​code>​ +
- +
-Puis désinstallation :  +
- +
-<​code>​jupyter labextension uninstall nbdime-jupyterlab</​code>​ +
- +
-Installation de la version 1.1.0 +
- +
-<​code>​jupyter labextension enable nbdime@1.1.0</​code>​ +
- +
-<​code>​jupyter lab build</​code>​ +
- +
-<​code>​jupyter labextension install nbdime-jupyterlab</​code>​ +
- +
-Après avoir fermé puis relancé Jupyterlab le problème semble avoir disparu. En tout cas, il est possible d'​accéder au carnet jupyter **import_csv.ipynb** évoqué plus loin.+
  
 ====== Configuration des plugins JupyterLab ====== ====== Configuration des plugins JupyterLab ======
python/anaconda.txt · Dernière modification: 2024/02/23 01:38 par Francesco Beretta