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python:anaconda

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python:anaconda [2020/09/29 10:25]
Francesco Beretta
python:anaconda [2020/09/29 13:03]
Francesco Beretta
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 Retour à l'​accueil [[python:​accueil|Python pour les historiens]] Retour à l'​accueil [[python:​accueil|Python pour les historiens]]
  
-======= Installer et configurer son environnement ​virtuel ​Python =======+======= Installer et configurer son environnement ​de travail ​Python ======= 
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 Les environnements virtuels fournissent un moyen puissant pour isoler les paquets utilisés dans un projet utilisant Python et leurs dépendances. Cela signifie que vous pouvez utiliser des paquets particuliers à un projet sans les installer sur l’ensemble du système, en évitant ainsi les conflits de version potentiels et en assurant la cohérence de l'​environnement. Les environnements virtuels fournissent un moyen puissant pour isoler les paquets utilisés dans un projet utilisant Python et leurs dépendances. Cela signifie que vous pouvez utiliser des paquets particuliers à un projet sans les installer sur l’ensemble du système, en évitant ainsi les conflits de version potentiels et en assurant la cohérence de l'​environnement.
 Cf. [[https://​docs.python.org/​fr/​3/​tutorial/​venv.html|Environnements virtuels et paquets]]. Cf. [[https://​docs.python.org/​fr/​3/​tutorial/​venv.html|Environnements virtuels et paquets]].
  
-Plusieurs outils de gestion d'​environnements virtuels existent, construits autour de PIP (cf. documentation officielle de Python). Comme nous pratiquons ici une approche orientée analyse de données (et non développement web ou développement d'​applications),​ nous avons privilégié le gestionnaire de paquets Conda (cf. ci-dessous). De plus, Conda permet d'​installer des paquets d'​autres langages informatiques,​ tel R, node.js ou java. Il est donc particulièrement intéressant et fléxible pour notre but.d+Plusieurs outils de gestion d'​environnements virtuels existent, construits autour de PIP (cf. documentation officielle de Python). Comme nous pratiquons ici une approche orientée analyse de données (et non développement web ou développement d'​applications),​ nous avons privilégié le gestionnaire de paquets Conda (cf. ci-dessous). De plus, Conda permet d'​installer des paquets d'​autres langages informatiques,​ tel R, node.js ou java. Il est donc particulièrement intéressant et fléxible pour notre but.
  
  
-====== ​Documentation et tutoriels ​====== +====== ​Miniconda / Anaconda ​======
- +
-===== Anaconda/​Miniconda ​=====+
  
   * [[https://​www.anaconda.com/​what-is-anaconda/​|Ce qu'est Anaconda]] – [[https://​docs.conda.io/​projects/​conda/​en/​latest/​index.html|ce qu'est Conda]]   * [[https://​www.anaconda.com/​what-is-anaconda/​|Ce qu'est Anaconda]] – [[https://​docs.conda.io/​projects/​conda/​en/​latest/​index.html|ce qu'est Conda]]
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   * [[https://​zestedesavoir.com/​tutoriels/​1448/​installer-un-environnement-de-developpement-python-avec-conda|Tutoriel en français]] concernant l'​utilisation de //conda//.   * [[https://​zestedesavoir.com/​tutoriels/​1448/​installer-un-environnement-de-developpement-python-avec-conda|Tutoriel en français]] concernant l'​utilisation de //conda//.
   * [[https://​docs.conda.io/​projects/​conda/​en/​latest/​user-guide/​getting-started.html|Tutoriel en anglais]] de conda   * [[https://​docs.conda.io/​projects/​conda/​en/​latest/​user-guide/​getting-started.html|Tutoriel en anglais]] de conda
-  * **[[python:​environnement_conda|Créer et gérer un environnement Conda]]** 
  
-===== JupyterLab git extension ===== 
  
-Documentation concernant //​JupyterLab git extension//:​ 
-  * [[https://​github.com/​jupyterlab/​jupyterlab-git|jupyterlab / jupyterlab-git]] ​ 
-  * Tutoriel [[https://​annefou.github.io/​jupyter_publish/​02-git/​index.html|JupyterLab git extension]] 
-  * Un tutoriel très intéressant sur Jupyter Lab dont la partie 3 concerne GitHub: [[http://​jakevdp.github.io/​blog/​2017/​03/​03/​reproducible-data-analysis-in-jupyter/​|Reproducible Data Analysis in Jupyter]] 
  
-**/!\ Avant de faire le tutoriel, réfléchissez si vous devez créer un nouveau environnement virtuel, si vous avez déjà d'​autres projets en cours.** Il est donc préférable de créer un environnement en ligne de commande. Voir ci-dessous pour l'​installation de l'​environnement. +===== Installation de Miniconda =====
-\\ Une fois que vous avez activé votre environnement dans Miniconda, pensez à installer **JupyterLab**. Jupyter Notebook sera automatiquement installé avec. +
-\\ Une fois JupyterLab installé, lancez le, il s'​affichera sur votre navigateur. +
- +
- +
-Les paquets pour conda: +
-  * [[https://​anaconda.org/​conda-forge/​jupyterlab-git|jupyterlab-git]] ([[https://​github.com/​jupyterlab/​jupyterlab-git|documentation sur GitHub]]) +
-  * [[https://​anaconda.org/​krinsman/​jupyterlab-github|jupyterlab-github]] ([[https://​github.com/​jupyterlab/​jupyterlab-github|Documentation sur Github]]) +
- +
-====== Installation de Miniconda ​avec JupyterLab et ses plugins ======+
  
 **Miniconda est à préférer car c'est environnement beaucoup plus léger** (mais à utiliser en ligne de commande). **Miniconda est à préférer car c'est environnement beaucoup plus léger** (mais à utiliser en ligne de commande).
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   * Exécuter tout d'​abord une mise à jour de Conda: ​ <​code>​conda update conda</​code>​   * Exécuter tout d'​abord une mise à jour de Conda: ​ <​code>​conda update conda</​code>​
     * Lorsque l'​exécutable imprime la liste des paquets à mettre à jour et  demande: installer y/n ? répondre y = yes     * Lorsque l'​exécutable imprime la liste des paquets à mettre à jour et  demande: installer y/n ? répondre y = yes
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 +===== Gérer un environnement avec Conda =====
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 +Page dédiée de ce Wiki:
 +  * **[[python:​environnement_conda|Créer et gérer un environnement Conda]]**
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 +====== Installation de JupyterLab et ses plugins ======
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   * Lister les environnemnents disponibles <​code>​conda env list</​code>​   * Lister les environnemnents disponibles <​code>​conda env list</​code>​
   * Créer ensuite un environnement contenant Jupyter Lab: conda create --name <​envname>​ python=<​version>​.   * Créer ensuite un environnement contenant Jupyter Lab: conda create --name <​envname>​ python=<​version>​.
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-==== Problèmes / Bugs ==== 
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-Voir les [[python:​bugs_connus_conda|Problèmes / Bugs]] connus concernant l'​installation de Miniconda ou de ses plugins 
  
 ====== Configuration des plugins JupyterLab ====== ====== Configuration des plugins JupyterLab ======
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 +
 +===== JupyterLab git extension =====
 +
 +Documentation concernant //​JupyterLab git extension//:​
 +  * [[https://​github.com/​jupyterlab/​jupyterlab-git|jupyterlab / jupyterlab-git]] ​
 +  * Tutoriel [[https://​annefou.github.io/​jupyter_publish/​02-git/​index.html|JupyterLab git extension]]
 +  * Un tutoriel très intéressant sur Jupyter Lab dont la partie 3 concerne GitHub: [[http://​jakevdp.github.io/​blog/​2017/​03/​03/​reproducible-data-analysis-in-jupyter/​|Reproducible Data Analysis in Jupyter]]
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 +**/!\ Avant de faire le tutoriel, réfléchissez si vous devez créer un nouveau environnement virtuel, si vous avez déjà d'​autres projets en cours.** Il est donc préférable de créer un environnement en ligne de commande. Voir ci-dessous pour l'​installation de l'​environnement.
 +\\ Une fois que vous avez activé votre environnement dans Miniconda, pensez à installer **JupyterLab**. Jupyter Notebook sera automatiquement installé avec.
 +\\ Une fois JupyterLab installé, lancez le, il s'​affichera sur votre navigateur.
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 +Les paquets pour conda:
 +  * [[https://​anaconda.org/​conda-forge/​jupyterlab-git|jupyterlab-git]] ([[https://​github.com/​jupyterlab/​jupyterlab-git|documentation sur GitHub]])
 +  * [[https://​anaconda.org/​krinsman/​jupyterlab-github|jupyterlab-github]] ([[https://​github.com/​jupyterlab/​jupyterlab-github|Documentation sur Github]])
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 ===== Plugin jupyterlab-github ===== ===== Plugin jupyterlab-github =====
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 Plus haut vous pouvez aussi constater "​Current Repository",​ "​Current Branch"​ qui vous permettra de gérer les branches. Plus haut vous pouvez aussi constater "​Current Repository",​ "​Current Branch"​ qui vous permettra de gérer les branches.
  
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 +====== Problèmes / Bugs ======
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 +Voir les [[python:​bugs_connus_conda|Problèmes / Bugs]] connus concernant l'​installation de Miniconda ou de ses plugins
python/anaconda.txt · Dernière modification: 2024/02/23 01:38 par Francesco Beretta