Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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python:anaconda [2022/02/19 15:27] Francesco Beretta |
python:anaconda [2024/02/23 01:25] Francesco Beretta [Installation et activation de JupyterLab] |
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* [[https://www.anaconda.com/what-is-anaconda/|Ce qu'est Anaconda]] – [[https://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/index.html|ce qu'est Conda]] | * [[https://www.anaconda.com/what-is-anaconda/|Ce qu'est Anaconda]] – [[https://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/index.html|ce qu'est Conda]] | ||
- | * Installer [[https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html|Miniconda]]. Dans le cadre de ce tutoriel, la version de python de référence est la **3.9**. | + | * **Installer [[https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html|Miniconda]].** Dans le cadre de ce tutoriel, la version de python de référence est la **3.9**. |
* Quelle différence entre Anaconda et Miniconda ? [[https://www.anaconda.com/download/|Anaconda]] apporte, en plus du gestionnaire d'environnements Python //conda//, une interface graphique complète et différents logiciels. L'environnement risque d'être un peu lourd – pour des petits projets **Miniconda** est préférable. Il n'est pas recommandé, dans le cadre de cet atelier, de créer un environnement avec le logiciel Anaconda, car cela pose problème par la suite. | * Quelle différence entre Anaconda et Miniconda ? [[https://www.anaconda.com/download/|Anaconda]] apporte, en plus du gestionnaire d'environnements Python //conda//, une interface graphique complète et différents logiciels. L'environnement risque d'être un peu lourd – pour des petits projets **Miniconda** est préférable. Il n'est pas recommandé, dans le cadre de cet atelier, de créer un environnement avec le logiciel Anaconda, car cela pose problème par la suite. | ||
* [[https://zestedesavoir.com/tutoriels/1448/installer-un-environnement-de-developpement-python-avec-conda|Tutoriel en français]] concernant l'utilisation de //conda//. | * [[https://zestedesavoir.com/tutoriels/1448/installer-un-environnement-de-developpement-python-avec-conda|Tutoriel en français]] concernant l'utilisation de //conda//. | ||
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* Vérifier l'installation de Conda en exécutant la commande ci-dessous qui donne la version de conda: <code>conda info</code> | * Vérifier l'installation de Conda en exécutant la commande ci-dessous qui donne la version de conda: <code>conda info</code> | ||
* la liste des paquets installés dans l'environnement de base: <code>conda list</code> | * la liste des paquets installés dans l'environnement de base: <code>conda list</code> | ||
+ | * la liste des environnements disponibles: <code>conda env list</code> | ||
+ | * Au début il n'y aura que l'nevironnement de 'base' | ||
+ | * Attention : n'installer aucun paquet dans l'environnement de base ! Toujours créer un nouvel environnement. | ||
* En cas d'erreur, si par exemple CMD (Windows) / Terminal (MacOS) renvoit le message d'erreur suivant <code>conda: command not found error</code> voir Problèmes / Bugs ci-dessous. | * En cas d'erreur, si par exemple CMD (Windows) / Terminal (MacOS) renvoit le message d'erreur suivant <code>conda: command not found error</code> voir Problèmes / Bugs ci-dessous. | ||
* Exécuter tout d'abord une mise à jour de Conda: <code>conda update conda</code> | * Exécuter tout d'abord une mise à jour de Conda: <code>conda update conda</code> | ||
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====== Installation de JupyterLab ====== | ====== Installation de JupyterLab ====== | ||
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+ | ===== Ajout du canal conda-forge et installation de Mamba ===== | ||
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* Ajouter le canal 'conda-forge' : <code>conda config --add channels conda-forge</code> | * Ajouter le canal 'conda-forge' : <code>conda config --add channels conda-forge</code> | ||
* Vérifier l'ajout du canal <code>conda info</code>: apparait la liste des canaux | * Vérifier l'ajout du canal <code>conda info</code>: apparait la liste des canaux | ||
+ | * Vérifier la liste des canaux prioritaires: <code>conda config --show channels</code> doit donner comme résultat: | ||
+ | <code>channels: | ||
+ | - conda-forge | ||
+ | - defaults | ||
+ | </code> | ||
+ | * Si l'ordre est inversé, effectuer: <code>conda config --set channel_priority strict</code>, puis vérifier l'ordre des canaux avec <code>conda config --show channels</code> 'conda-forge' doit être en premier. | ||
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+ | ===== Installation et activation de JupyterLab ===== | ||
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+ | Afin de disposer d'une installation propre de Jupyterlab on va créer un environnement //Conda// qui lui est dédié et dans lequel on n'installera pas d'autres librairies. Afin d'effectuer des analyses de données ou autres traitements, on crééera ensuite des environnements //Conda// appropriés qu'on activera dans Jupyterlab. | ||
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+ | * Avant toute nouvelle installation: <code>conda update conda</code> | ||
+ | * Créer ensuite un environnement contenant Jupyter Lab. Voici la syntaxe à utiliser, on l'appliquera selon les exemples ci-dessous : <code>conda create --name <envname> python=<version></code>. | ||
+ | * Pour **MacOS** et **Windows 64 bits** exécuter: <code>conda create --name env_jupyterlab python=3.11 jupyterlab</code> | ||
+ | * Pour Windows **si système à 32-bit**: | ||
+ | * Si système à 32 bits exécuter: <code>conda create --name env_jupyterlab python=3.11 jupyterlab pywin32</code> | ||
+ | * Lorsque l'exécutable demande : installer Y/n répondre Y = yes | ||
+ | * Lister les environnemnents disponibles: <code>conda env list</code> | ||
- | * Créer ensuite un environnement contenant Jupyter Lab: conda create --name <envname> python=<version>. | + | * Pour effecer un environnement et ses paquets, exécuter: |
- | * Pour **MacOS** exécuter: <code>conda create --name py37_jupyterlab python=3.7 jupyterlab=1.2.7 requests</code> | + | <code>conda remove --name myenv --all</code> |
- | * Pour **Windows** système à 32-bit exécuter: <code>conda create --name py37_jupyterlab python=3.7 jupyterlab pywin32 requests</code> | + | |
- | * Lorsque l'exécutable demande : installer y/n répondre y = yes | ||
- | * Activer le nouvel environnement : <code>conda activate py37_jupyterlab</code> | + | * Activer le nouvel environnement : <code>conda activate env_jupyterlab</code> |
* Pour désactiver l'environnement et revenir à l'environnement 'base: <code>conda deactivate</code> | * Pour désactiver l'environnement et revenir à l'environnement 'base: <code>conda deactivate</code> | ||
+ | * Déplacer la position du Terminal vers le dossier dans lequel on mettra les notebooks (et les sous-dossiers des projets Github):<code>cd /root/folder/dossier_python/</code> Syntaxe Windows:<code>cd C:\Users\My_Name\Documents\dossier_python</code> | ||
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* Démarrer Juypter Lab : <code>jupyter lab</code> | * Démarrer Juypter Lab : <code>jupyter lab</code> | ||
* Pour **arrêter Jupyter Lab**: taper dans le Terminal ou Prompt où il est actif **alt-C** pour Windows ou **ctrl-C** pour Mac. | * Pour **arrêter Jupyter Lab**: taper dans le Terminal ou Prompt où il est actif **alt-C** pour Windows ou **ctrl-C** pour Mac. | ||
+ | * En cas de problèmes avec l'antivirus (surréaction et annonce de virus [[https://justuto.com/idp-generic-virus/|voir cette page]]) | ||
* Si on veut ajouter des nouveau paquets à l'environnement, **arrêter Jupyter Lab** , puis ajouter les paquets à l'environnement actif, dans ce cas //py37_gitlab// puis relancer le Lab. | * Si on veut ajouter des nouveau paquets à l'environnement, **arrêter Jupyter Lab** , puis ajouter les paquets à l'environnement actif, dans ce cas //py37_gitlab// puis relancer le Lab. | ||
- | * Pour utiliser différents environnements, dédiés à différents projets ou technologies (NLP, etc.) voir les [[python:environnement_conda&#creer_un_nouvel_environnement_atelier_et_l_ajouter_aux_kernels_de_jupyter_lab|instructions sur cette page]] | + | * ATTENTION: mieux vaut toutefois garder l'environnement 'env_jupyterlab' uniquement pour JupyterLab et ses extentions. |
+ | * Pour l'analyse de données, créer des environnements dédiés à différents projets ou technologies (NLP, etc.) qui seront activés dans jupyterlab. **voir les [[python:environnement_conda&#creer_un_nouvel_environnement_atelier_et_l_ajouter_aux_kernels_de_jupyter_lab|instructions sur cette page]]** | ||
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- | L'installation de ce qui suit n'est pas nécessaire pour les cas d'usage habituels. | + | ATTENTION : l'installation de ce qui suit __n'est pas nécessaire__ (à éviter pour les utilisateurs·trices non expérimenté·e·s). |
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Voir les [[python:bugs_connus_conda|Problèmes / Bugs]] connus concernant l'installation de Miniconda, JupyterLab et ses plugins | Voir les [[python:bugs_connus_conda|Problèmes / Bugs]] connus concernant l'installation de Miniconda, JupyterLab et ses plugins | ||
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+ | ====== Installation de Mamba ====== | ||
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+ | [février 2024] NB: Mamba a évolué, ne plus installer avec cette méthode — cf. la doc. | ||
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+ | Gardé ici pour mémoire mais à revoir: | ||
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+ | * Installation de Mamba dans l'environnement de base de Conda: <code>conda install mamba -n base</code> | ||
+ | * Une mise à jour de beaucoup de paquets est effectuée | ||
+ | * Test de l'installation de Mamba: | ||
+ | * <code>mamba info</code> | ||
+ | * <code>conda list</code>, cf. le paquet mamba. | ||
+ | * Cf. la [[https://mamba.readthedocs.io/en/latest/user_guide/mamba.html|documentation de Mamba]] |