Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
Les deux révisions précédentes Révision précédente Prochaine révision | Révision précédente | ||
python:anaconda [2022/02/19 15:30] Francesco Beretta [Vérification de l'installation] |
python:anaconda [2024/02/23 01:38] Francesco Beretta [Gestion des environnements virtuels] |
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Cf. [[https://docs.python.org/fr/3/tutorial/venv.html|Environnements virtuels et paquets]]. | Cf. [[https://docs.python.org/fr/3/tutorial/venv.html|Environnements virtuels et paquets]]. | ||
- | Plusieurs outils de gestion d'environnements virtuels existent, construits autour de PIP (cf. documentation officielle de Python). Comme nous pratiquons ici une approche orientée analyse de données (et non développement web ou développement d'applications), nous avons privilégié le gestionnaire de paquets Conda (cf. ci-dessous), ainsi qu'un édrivé plus performant appelé [[https://mamba.readthedocs.io/en/latest/index.html|Mamba]]. | + | Plusieurs outils de gestion d'environnements virtuels existent, construits autour de PIP (cf. documentation officielle de Python). Comme nous pratiquons ici une approche orientée analyse de données (et non développement web ou développement d'applications), nous avons privilégié le gestionnaire de paquets Conda (cf. ci-dessous). |
Ces deux gestionnaires d'environnements permettent d'installer des paquets d'autres langages informatiques, tel R, node.js ou java. Il est donc particulièrement intéressant et fléxible pour notre but. | Ces deux gestionnaires d'environnements permettent d'installer des paquets d'autres langages informatiques, tel R, node.js ou java. Il est donc particulièrement intéressant et fléxible pour notre but. | ||
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* [[https://www.anaconda.com/what-is-anaconda/|Ce qu'est Anaconda]] – [[https://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/index.html|ce qu'est Conda]] | * [[https://www.anaconda.com/what-is-anaconda/|Ce qu'est Anaconda]] – [[https://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/index.html|ce qu'est Conda]] | ||
- | * Installer [[https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html|Miniconda]]. Dans le cadre de ce tutoriel, la version de python de référence est la **3.9**. | + | * **Installer [[https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html|Miniconda]].** Dans le cadre de ce tutoriel, la version de python de référence est la **3.9**. |
* Quelle différence entre Anaconda et Miniconda ? [[https://www.anaconda.com/download/|Anaconda]] apporte, en plus du gestionnaire d'environnements Python //conda//, une interface graphique complète et différents logiciels. L'environnement risque d'être un peu lourd – pour des petits projets **Miniconda** est préférable. Il n'est pas recommandé, dans le cadre de cet atelier, de créer un environnement avec le logiciel Anaconda, car cela pose problème par la suite. | * Quelle différence entre Anaconda et Miniconda ? [[https://www.anaconda.com/download/|Anaconda]] apporte, en plus du gestionnaire d'environnements Python //conda//, une interface graphique complète et différents logiciels. L'environnement risque d'être un peu lourd – pour des petits projets **Miniconda** est préférable. Il n'est pas recommandé, dans le cadre de cet atelier, de créer un environnement avec le logiciel Anaconda, car cela pose problème par la suite. | ||
* [[https://zestedesavoir.com/tutoriels/1448/installer-un-environnement-de-developpement-python-avec-conda|Tutoriel en français]] concernant l'utilisation de //conda//. | * [[https://zestedesavoir.com/tutoriels/1448/installer-un-environnement-de-developpement-python-avec-conda|Tutoriel en français]] concernant l'utilisation de //conda//. | ||
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====== Installation de JupyterLab ====== | ====== Installation de JupyterLab ====== | ||
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+ | ===== Ajout du canal conda-forge et installation de Mamba ===== | ||
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* Ajouter le canal 'conda-forge' : <code>conda config --add channels conda-forge</code> | * Ajouter le canal 'conda-forge' : <code>conda config --add channels conda-forge</code> | ||
* Vérifier l'ajout du canal <code>conda info</code>: apparait la liste des canaux | * Vérifier l'ajout du canal <code>conda info</code>: apparait la liste des canaux | ||
+ | * Vérifier la liste des canaux prioritaires: <code>conda config --show channels</code> doit donner comme résultat: | ||
+ | <code>channels: | ||
+ | - conda-forge | ||
+ | - defaults | ||
+ | </code> | ||
+ | * Si l'ordre est inversé, effectuer: <code>conda config --set channel_priority strict</code>, puis vérifier l'ordre des canaux avec <code>conda config --show channels</code> 'conda-forge' doit être en premier. | ||
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+ | ===== Installation et activation de JupyterLab ===== | ||
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+ | Afin de disposer d'une installation propre de Jupyterlab on va créer un environnement //Conda// qui lui est dédié et dans lequel on n'installera pas d'autres librairies. Afin d'effectuer des analyses de données ou autres traitements, on crééera ensuite des environnements //Conda// appropriés qu'on activera dans Jupyterlab. | ||
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+ | * Avant toute nouvelle installation: <code>conda update conda</code> | ||
+ | * Créer ensuite un environnement contenant Jupyter Lab. Voici la syntaxe à utiliser, on l'appliquera selon les exemples ci-dessous : <code>conda create --name <envname> python=<version></code>. | ||
+ | * Pour **MacOS** et **Windows 64 bits** exécuter: <code>conda create --name env_jupyterlab python=3.11 jupyterlab</code> | ||
+ | * Pour Windows **si système à 32-bit**: | ||
+ | * Si système à 32 bits exécuter: <code>conda create --name env_jupyterlab python=3.11 jupyterlab pywin32</code> | ||
+ | * Lorsque l'exécutable demande : installer Y/n répondre Y = yes | ||
+ | * Lister les environnemnents disponibles: <code>conda env list</code> | ||
- | * Créer ensuite un environnement contenant Jupyter Lab: conda create --name <envname> python=<version>. | + | * Pour effecer un environnement et ses paquets, exécuter: |
- | * Pour **MacOS** exécuter: <code>conda create --name py37_jupyterlab python=3.7 jupyterlab=1.2.7 requests</code> | + | <code>conda remove --name myenv --all</code> |
- | * Pour **Windows** système à 32-bit exécuter: <code>conda create --name py37_jupyterlab python=3.7 jupyterlab pywin32 requests</code> | + | |
- | * Lorsque l'exécutable demande : installer y/n répondre y = yes | ||
- | * Activer le nouvel environnement : <code>conda activate py37_jupyterlab</code> | + | * Activer le nouvel environnement : <code>conda activate env_jupyterlab</code> |
* Pour désactiver l'environnement et revenir à l'environnement 'base: <code>conda deactivate</code> | * Pour désactiver l'environnement et revenir à l'environnement 'base: <code>conda deactivate</code> | ||
+ | * Déplacer la position du Terminal vers le dossier dans lequel on mettra les notebooks (et les sous-dossiers des projets Github):<code>cd /root/folder/dossier_python/</code> Syntaxe Windows:<code>cd C:\Users\My_Name\Documents\dossier_python</code> | ||
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* Démarrer Juypter Lab : <code>jupyter lab</code> | * Démarrer Juypter Lab : <code>jupyter lab</code> | ||
* Pour **arrêter Jupyter Lab**: taper dans le Terminal ou Prompt où il est actif **alt-C** pour Windows ou **ctrl-C** pour Mac. | * Pour **arrêter Jupyter Lab**: taper dans le Terminal ou Prompt où il est actif **alt-C** pour Windows ou **ctrl-C** pour Mac. | ||
+ | * En cas de problèmes avec l'antivirus (surréaction et annonce de virus [[https://justuto.com/idp-generic-virus/|voir cette page]]) | ||
* Si on veut ajouter des nouveau paquets à l'environnement, **arrêter Jupyter Lab** , puis ajouter les paquets à l'environnement actif, dans ce cas //py37_gitlab// puis relancer le Lab. | * Si on veut ajouter des nouveau paquets à l'environnement, **arrêter Jupyter Lab** , puis ajouter les paquets à l'environnement actif, dans ce cas //py37_gitlab// puis relancer le Lab. | ||
- | * Pour utiliser différents environnements, dédiés à différents projets ou technologies (NLP, etc.) voir les [[python:environnement_conda&#creer_un_nouvel_environnement_atelier_et_l_ajouter_aux_kernels_de_jupyter_lab|instructions sur cette page]] | + | * ATTENTION: mieux vaut toutefois garder l'environnement 'env_jupyterlab' uniquement pour JupyterLab et ses extentions. |
+ | * Pour l'analyse de données, créer des environnements dédiés à différents projets ou technologies (NLP, etc.) qui seront activés dans jupyterlab. **voir les [[python:environnement_conda&#creer_un_nouvel_environnement_atelier_et_l_ajouter_aux_kernels_de_jupyter_lab|instructions sur cette page]]** | ||
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- | L'installation de ce qui suit n'est pas nécessaire pour les cas d'usage habituels. | + | ATTENTION : l'installation de ce qui suit __n'est pas nécessaire__ (à éviter pour les utilisateurs·trices non expérimenté·e·s). |
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Voir les [[python:bugs_connus_conda|Problèmes / Bugs]] connus concernant l'installation de Miniconda, JupyterLab et ses plugins | Voir les [[python:bugs_connus_conda|Problèmes / Bugs]] connus concernant l'installation de Miniconda, JupyterLab et ses plugins | ||
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+ | ====== Installation de Mamba ====== | ||
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+ | [février 2024] NB: Mamba a évolué, ne plus installer avec cette méthode — cf. la doc. | ||
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+ | Gardé ici pour mémoire mais à revoir: | ||
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+ | * Installation de Mamba dans l'environnement de base de Conda: <code>conda install mamba -n base</code> | ||
+ | * Une mise à jour de beaucoup de paquets est effectuée | ||
+ | * Test de l'installation de Mamba: | ||
+ | * <code>mamba info</code> | ||
+ | * <code>conda list</code>, cf. le paquet mamba. | ||
+ | * Cf. la [[https://mamba.readthedocs.io/en/latest/user_guide/mamba.html|documentation de Mamba]] |