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python:anaconda

Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

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python:anaconda [2022/02/19 15:47]
Francesco Beretta [Ajout du canal conda-forge et installation de Mamba]
python:anaconda [2024/02/23 01:38] (Version actuelle)
Francesco Beretta [Gestion des environnements virtuels]
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 Cf. [[https://​docs.python.org/​fr/​3/​tutorial/​venv.html|Environnements virtuels et paquets]]. Cf. [[https://​docs.python.org/​fr/​3/​tutorial/​venv.html|Environnements virtuels et paquets]].
  
-Plusieurs outils de gestion d'​environnements virtuels existent, construits autour de PIP (cf. documentation officielle de Python). Comme nous pratiquons ici une approche orientée analyse de données (et non développement web ou développement d'​applications),​ nous avons privilégié le gestionnaire de paquets Conda (cf. ci-dessous), ainsi qu'un édrivé plus performant appelé [[https://​mamba.readthedocs.io/​en/​latest/​index.html|Mamba]]+Plusieurs outils de gestion d'​environnements virtuels existent, construits autour de PIP (cf. documentation officielle de Python). Comme nous pratiquons ici une approche orientée analyse de données (et non développement web ou développement d'​applications),​ nous avons privilégié le gestionnaire de paquets Conda (cf. ci-dessous). ​
  
 Ces deux gestionnaires d'​environnements permettent d'​installer des paquets d'​autres langages informatiques,​ tel R, node.js ou java. Il est donc particulièrement intéressant et fléxible pour notre but. Ces deux gestionnaires d'​environnements permettent d'​installer des paquets d'​autres langages informatiques,​ tel R, node.js ou java. Il est donc particulièrement intéressant et fléxible pour notre but.
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   * [[https://​www.anaconda.com/​what-is-anaconda/​|Ce qu'est Anaconda]] – [[https://​docs.conda.io/​projects/​conda/​en/​latest/​index.html|ce qu'est Conda]]   * [[https://​www.anaconda.com/​what-is-anaconda/​|Ce qu'est Anaconda]] – [[https://​docs.conda.io/​projects/​conda/​en/​latest/​index.html|ce qu'est Conda]]
-  * Installer [[https://​docs.conda.io/​en/​latest/​miniconda.html|Miniconda]]. Dans le cadre de ce tutoriel, la version de python de référence est la **3.9**.+  ​* **Installer [[https://​docs.conda.io/​en/​latest/​miniconda.html|Miniconda]].** Dans le cadre de ce tutoriel, la version de python de référence est la **3.9**.
     * Quelle différence entre Anaconda et Miniconda ? [[https://​www.anaconda.com/​download/​|Anaconda]] apporte, en plus du gestionnaire d'​environnements Python //conda//, une interface graphique complète et différents logiciels. L'​environnement risque d'​être un peu lourd – pour des petits projets **Miniconda** est préférable. Il n'est pas recommandé,​ dans le cadre de cet atelier, de créer un environnement avec le logiciel Anaconda, car cela pose problème par la suite.     * Quelle différence entre Anaconda et Miniconda ? [[https://​www.anaconda.com/​download/​|Anaconda]] apporte, en plus du gestionnaire d'​environnements Python //conda//, une interface graphique complète et différents logiciels. L'​environnement risque d'​être un peu lourd – pour des petits projets **Miniconda** est préférable. Il n'est pas recommandé,​ dans le cadre de cet atelier, de créer un environnement avec le logiciel Anaconda, car cela pose problème par la suite.
   * [[https://​zestedesavoir.com/​tutoriels/​1448/​installer-un-environnement-de-developpement-python-avec-conda|Tutoriel en français]] concernant l'​utilisation de //conda//.   * [[https://​zestedesavoir.com/​tutoriels/​1448/​installer-un-environnement-de-developpement-python-avec-conda|Tutoriel en français]] concernant l'​utilisation de //conda//.
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   * Si l'​ordre est inversé, effectuer: <​code>​conda config --set channel_priority strict</​code>,​ puis vérifier l'​ordre des canaux avec <​code>​conda config --show channels</​code>​ '​conda-forge'​ doit être en premier.   * Si l'​ordre est inversé, effectuer: <​code>​conda config --set channel_priority strict</​code>,​ puis vérifier l'​ordre des canaux avec <​code>​conda config --show channels</​code>​ '​conda-forge'​ doit être en premier.
  
-  * Installation de Mamba dans l'​environnement de base de Conda: <​code>​conda install mamba -n base</​code>​ +
-  * Test de l'​installation de Mamba: +
-    * <​code>​conda list</​code>,​ vérif. le paquet mamba.+
 ===== Installation et activation de JupyterLab ===== ===== Installation et activation de JupyterLab =====
  
-  ​* Créer ensuite un environnement contenant Jupyter Lab: <​code>​conda create --name <​envname>​ python=<​version></​code>​. +Afin de disposer d'une installation propre de Jupyterlab on va créer un environnement //Conda// qui lui est dédié et dans lequel on n'​installera pas d'​autres librairies. Afin d'​effectuer des analyses de données ou autres traitements,​ on crééera ensuite des environnements //Conda// appropriés qu'on activera dans Jupyterlab. 
-  * Pour **MacOS** exécuter: ​ <​code>​conda create --name env_jupyterlab ​requests</​code>​ + 
-  * Pour **Windows** ​la même chose sauf si système à 32-bit + 
-    * Pour 32 bits exécuter: <​code>​conda create --name env_jupyterlab jupyterlab pywin32 ​requests</​code>​+  * Avant toute nouvelle installation:​ <​code>​conda update conda</​code>​ 
 +  ​* Créer ensuite un environnement contenant Jupyter Lab. Voici la syntaxe à utiliser, on l'​appliquera selon les exemples ci-dessous ​: <​code>​conda create --name <​envname>​ python=<​version></​code>​. 
 +  * Pour **MacOS** et **Windows 64 bits** exécuter: ​ <​code>​conda create --name env_jupyterlab ​python=3.11 jupyterlab</​code>​ 
 +  * Pour Windows **si système à 32-bit**:  
 +    * Si système à 32 bits exécuter: <​code>​conda create --name env_jupyterlab ​python=3.11 ​jupyterlab pywin32</​code>​ 
 + 
 +  * Lorsque l'​exécutable demande : installer Y/n répondre Y = yes 
 +  * Lister les environnemnents disponibles:​ <​code>​conda env list</​code>​ 
 + 
 +  * Pour effecer un environnement et ses paquets, exécuter:​ 
 +   <​code>​conda remove --name myenv --all</​code>​
  
-  * Lorsque l'​exécutable demande : installer y/n répondre y = yes 
  
  
-  * Activer le nouvel environnement : <​code>​conda activate ​py37_jupyterlab</​code>​+  * Activer le nouvel environnement : <​code>​conda activate ​env_jupyterlab</​code>​
   * Pour désactiver l'​environnement et revenir à l'​environnement 'base: <​code>​conda deactivate</​code>​   * Pour désactiver l'​environnement et revenir à l'​environnement 'base: <​code>​conda deactivate</​code>​
 +  * Déplacer la position du Terminal vers le dossier dans lequel on mettra les notebooks (et les sous-dossiers des projets Github):<​code>​cd /​root/​folder/​dossier_python/</​code>​ Syntaxe Windows:<​code>​cd C:​\Users\My_Name\Documents\dossier_python</​code>​
 + 
   * Démarrer Juypter Lab : <​code>​jupyter lab</​code>​   * Démarrer Juypter Lab : <​code>​jupyter lab</​code>​
   * Pour **arrêter Jupyter Lab**: taper dans le Terminal ou Prompt où il est actif **alt-C** pour Windows ou **ctrl-C** pour Mac.   * Pour **arrêter Jupyter Lab**: taper dans le Terminal ou Prompt où il est actif **alt-C** pour Windows ou **ctrl-C** pour Mac.
 +  * En cas de problèmes avec l'​antivirus (surréaction et annonce de virus [[https://​justuto.com/​idp-generic-virus/​|voir cette page]])
   * Si on veut ajouter des nouveau paquets à l'​environnement,​ **arrêter Jupyter Lab** , puis ajouter les paquets à l'​environnement actif, dans ce cas //​py37_gitlab//​ puis relancer le Lab.   * Si on veut ajouter des nouveau paquets à l'​environnement,​ **arrêter Jupyter Lab** , puis ajouter les paquets à l'​environnement actif, dans ce cas //​py37_gitlab//​ puis relancer le Lab.
-  * Pour utiliser différents environnements, dédiés à différents projets ou technologies (NLP, etc.) voir les [[python:​environnement_conda&#​creer_un_nouvel_environnement_atelier_et_l_ajouter_aux_kernels_de_jupyter_lab|instructions sur cette page]]+  ​* ATTENTION: mieux vaut toutefois garder l'​environnement '​env_jupyterlab'​ uniquement pour JupyterLab et ses extentions.  
 +  ​* Pour l'​analyse de donnéescréer des environnements ​dédiés à différents projets ou technologies (NLP, etc.) qui seront activés dans jupyterlab. **voir les [[python:​environnement_conda&#​creer_un_nouvel_environnement_atelier_et_l_ajouter_aux_kernels_de_jupyter_lab|instructions sur cette page]]**
  
  
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-L'​installation de ce qui suit n'est pas nécessaire ​pour les cas d'​usage habituels.+ATTENTION : l'​installation de ce qui suit __n'est pas nécessaire__ (à éviter ​pour les utilisateurs·trices non expérimenté·e·s).
  
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 Voir les [[python:​bugs_connus_conda|Problèmes / Bugs]] connus concernant l'​installation de Miniconda, JupyterLab et ses plugins Voir les [[python:​bugs_connus_conda|Problèmes / Bugs]] connus concernant l'​installation de Miniconda, JupyterLab et ses plugins
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 +====== Installation de Mamba ======
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 +[février 2024] NB: Mamba a évolué, ne plus installer avec cette méthode — cf. la doc.
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 +Gardé ici pour mémoire mais à revoir:
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 +  * Installation de Mamba dans l'​environnement de base de Conda: <​code>​conda install mamba -n base</​code>​
 +    * Une mise à jour de beaucoup de paquets est effectuée
 +  * Test de l'​installation de Mamba:
 +    * <​code>​mamba info</​code>​
 +    * <​code>​conda list</​code>,​ cf. le paquet mamba.
 +  * Cf. la [[https://​mamba.readthedocs.io/​en/​latest/​user_guide/​mamba.html|documentation de Mamba]] ​
python/anaconda.1645282056.txt.gz · Dernière modification: 2022/02/19 15:47 par Francesco Beretta